A l'espera dels resultats del laboratori de referència, la seqüenciació de l'IRB no coincideix amb la soca detectada en els senglars

El Govern de la Generalitat ha traslladat avui al Ministeri d’Agricultura els resultats de l’anàlisi genòmica completa del virus de la pesta porcina africana (PPA) detectat recentment en porcs senglars a Cerdanyola del Vallès.

L’estudi de seqüenciació, liderat pel professor d’investigació ICREA Toni Gabaldón a l’Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona),  ha analitzat les 17 soques del virus de la PPA amb què s’ha treballat recentment al laboratori situat dins del radi del focus. Els resultats són concloents: cap d’aquestes soques coincideix genèticament amb la soca responsable del brot actual.

Les diferències observades són massa importants per establir cap relació directa. El virus detectat a Cerdanyola del Vallès presenta desenes de mutacions específiques i una gran deleció genòmica que no apareixen en cap de les soques del laboratori analitzades. Aquest conjunt de diferències no permeten confirmar que el brot tingui l’origen en aquestes mostres. Els laboratoris de referència del Ministeri i d’Europa hauran de confirmar els resultats.

La seqüenciació completa del genoma del virus del brot indica que es tracta d’una soca de PPA de genotip II, amb trets generals semblants al virus detectat anteriorment, però amb canvis genètics substancials no descrits prèviament. Aquesta “empremta genètica” singular inclou:

1. Una gran pèrdua d’un fragment del genoma (deleció).
2. Un conjunt de mutacions exclusives que no coincideixen amb les soques habituals que circulen actualment a Europa occidental.

Aquest patró genètic mostra més similituds amb alguns casos aïllats descrits en països de l’Europa de l’Est i d’Àsia, com Rússia, la Xina o Tailàndia, i indica que ens trobem davant d’una variant nova o no documentada fins ara. Tot i que encara es disposa d’altres soques històriques que encara s’estan seqüenciant a l’IRB, aquestes no han estat utilitzades recentment i presenten característiques genètiques molt més similars a virus detectats anteriorment que no pas a la del brot actual.

La seqüenciació genòmica completa és una eina clau perquè permet obtenir una autèntica “empremta digital” del virus, comparar-lo amb altres soques víriques conegudes i descartar o confirmar possibles vies d’origen amb un alt grau de fiabilitat científica.

La pesta porcina africana no es transmet per l’aire i requereix contacte directe o exposició continuada a material contaminat. En coherència amb l’experiència internacional, la hipòtesi més plausible és la introducció del virus a través de material contaminat, especialment aliments d’origen porcí, una via que ja s’ha identificat com a probable en brots detectats anteriorment en altres països europeus.